空间因素有车间面积和车间层高两个方面组成，它直接影响内部装修围护的成本：彩钢板隔墙及天花面积；空调投入成本：所需空调负荷的区域体积、空调的送回风方式、空调的管路走向及空调末端的数量。
避免因空间原因导致的项目投资增加，筹建商可以从两个方面综合考虑：不同的生产工艺设备的工作空间（含移动、维护检修的高度或宽度余量）；工作人流及物流的空间走向。目前建筑遵循节地、节材、节能的原则，所以净化车间并不是越高大越好，筹建时切实的考虑自身生产工艺设备及流程，能有效的规避不必要的投资成本。
定义净化车间的环境数据标准，是影响项目投资最至关重要的中心点。洁净度等级的制定影响装修成本：定在十万级及以上等级，要求有必要的洁净板材围护，净化门窗、人员和货物风淋传递设施，甚至价格昂贵的高价地板；同时也影响空调成本：洁净度越高，满足净化必要的空调换气次数就越大，所需净化风柜的风量就越大，风水管及末端高效风口量也随之增加。同理车间温湿度的制定，不仅也有上述成本问题，还有控制精确度的因素，精确度越高，所需的配套设备要越齐全。如相对湿度范围精确到±3%、±5%的时候，所需设计的加湿设备及除湿设备都要完备。
车间温湿度和洁净度的制定，不单只影响前期投资，对于一个基业长青的厂房来讲后期的运行成本也是极为重要，所以根据自身生产产品的特性，结合国标、行标以及企业内部标准，合理制定出符合自身需求的环境数据标准是筹建净化厂房最基础。
最合理的做法是先明确净化车间生产设备的参数（长宽高、排气量、发热量、产尘量），制定出满足自身需要的车间面积、层高、温湿度和洁净度要求，再交于设计方设计出一套合理的综合净化方案。作为筹建方不仅充分清楚自身需求，而且还能以此原则贯穿整个项目的设计、采购、施工、验收、试生产的质量、成本及进度控制，如此则恰到好处。
